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每种胶质瘤亚型定量鉴定的最佳规则分析

  除了潜在的生物标志物外,研究人员还建立了一个定量识别系统,该系统包含基于每个特定参数(基因)表达水平的24个定量规则。根据最近的出版物,可以确认每个规则的趋势和具体阈值,证明了这些规则的实用性。受文章长度的限制,研究人员筛选出每个胶质瘤亚型鉴定的代表性规则。
   制定了十条规则以有助于鉴定涉及多种功能基因的弥漫性星形细胞瘤。为了验证此类规则的有效性和准确性,研究人员总结了各种相关测序数据集的表达模式。由于文章长度的限制,单独分析每个规则是不可能的。因此,研究人员选择了三个最佳规则进行进一步分析:规则3,规则4和规则5.这三个规则涉及9个基因,每个基因共享具有不同阈值的XIST的高表达模式。在胶质瘤的相对早期阶段,弥漫性星形细胞瘤的恶性程度较低。XIST作为共有基因,已被证实参与肿瘤抑制生物过程; 其高表达对应于特定的病理模式。XIST的高表达已经被大多数弥漫性星形细胞瘤所共享,证实了它们的效力和这些规则的准确性。除了XIST 之外,还预测两种同源物,即RPL7和RPL8,在弥漫性星形细胞瘤中具有定量模式。根据规则,RPL7具有独特的高表达模式,而RPL8具有相对较低的表达模式。根据最近的出版物,已经在人类胎儿星形胶质细胞的早期阶段鉴定出这种模式。考虑到胎儿和肿瘤在差异状态水平上的相似性,研究人员推测在弥漫性星形细胞瘤中,RPL7和RPL8的表达水平可能与其他两种胶质瘤亚型完全不同。同样,基因如EGR1,EIF3C,HNRNPH1,C1orf61 ,CYP51A1 和CDR1也得到了最近出版物的验证。
   除了有助于识别弥漫性星形细胞瘤的过滤规则之外,还提出了13个用于胶质母细胞瘤验证的规则。研究人员筛选出规则11和规则12以进行详细分析。规则11包括四个功能基因,这表明高表达的HSPA1B和MARCKS,具有低表达一起RPSAP58和PRDX1,可以指示患者可能从成胶质细胞瘤受到影响。HSPA1B在胶质母细胞瘤中高表达,与厄洛替尼的药理作用有关。同时,MARCKS是胶质母细胞瘤的预后报告,有助于脑肿瘤增殖。因此,作为恶性肿瘤亚型胶质母细胞瘤,MARCKS的表达可能是鉴定胶质母细胞瘤的潜在生物标志物。剩下的两个下调的基因,RPSAP58和PRDX1,获得了类似的证据。同样地,在第12条,三个基因,包括COL20A1,CBR1,和MTRNR2L2,被上调,并且TCF12被下调。与其他两种星形细胞瘤亚型相比,这四种基因在表达模式水平上得到了证实,证实了该规则的高效性和准确性。不符合任何一项规则的样本被认为是间变性星形细胞瘤。
   总之,由于文章篇幅的限制,研究人员无法单独分析规则。但是,所有规则都可以通过最近的出版物进行验证,这意味着这些定量规则的有效性和准确性。因此,基于单细胞测序数据,研究人员尝试识别核心功能标记并建立用于这种区分的定量规则。本研究不仅可以筛选出一组候选生物标志物来识别不同的肿瘤亚型,而且还为探索和识别肿瘤相关基因提供了一种新的工具。

 
 
胶质瘤
  胶质瘤是颅内最常见的恶性肿瘤,发病率占颅内原发性肿瘤的50%,居第1位,多见于成人,好发部位以额叶、颞叶、顶叶居多。胶质瘤患者男性发病率高于女性,发病年龄以成人多见,30~40岁为发病高峰年龄。不同病理类型的胶质瘤各有其高发年龄,室管膜瘤的高发年龄在10岁以前,星形细胞瘤多见于中年人,老年人以胶质母细胞瘤多见。
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