目前用于诊断患有神经胶质瘤的患者的治疗方法显示出有限的成功。这部分是由于缺乏可用于准确预测疾病结果的预后基因。本研究的目的是根据肿瘤样本的分子谱及其与临床参数的相关性来研究新的预后基因。在目前的研究中，从GeneExpressionOmnibus下载的微阵列数据（GSE4412和GSE7696）用于通过长期存活者（>2年）和短期存活者之间的微阵列（SAM）的显着分析来鉴定差异表达的预后基因。幸存者（≤2岁）。从这两个数据集生成的DEPG相交以获得常见DEPG列表。然后通过实时逆转录定量PCR（qPCR）独立验证共同DEPG子集的表达。使用来自GSE4412和TCGA数据集的已知存活数据验证常见DEPG的存活值。在交叉从上述两个数据集生成的DEPG后，鉴定出三个可能用于确定胶质瘤患者预后的基因。胶质瘤患者组织的独立验证（n=70）和正常脑组织（n=19）发现PPIC，EMP3和CHI3L1在胶质瘤组织中上调。生存值验证显示这三个基因通过Kaplan-Meir分析与患者存活率相关，包括年级，年龄和治疗。
　　 作为人类中最常见的原发性中枢神经系统恶性肿瘤，胶质瘤的特征在于存在参与疾病进展的异质细胞。一般来说，胶质瘤分为两类：低级别胶质瘤（LGG，I或II），显示相对缓慢的生长;高级别胶质瘤（HGG，III或IV），其特点是快速生长和侵入正常脑组织。神经胶质瘤是高度致命的，大多数HGG患者从生活。多形性胶质母细胞瘤（GBM）-最常见和最恶性的胶质瘤类型-患者的中位生存时间仅为14.6个月，五年生存率低于10％。越来越多的努力来改善HGG治疗。最近，一些研究都集中在利用基因表达图谱，以确定诊断，预后，分期和治疗发展潜力的新的生物标志物。多项研究表明恶性神经胶质瘤的是基于基因表达的分类可以与相关联的生存比组织学分类，并提供识别以前未识别的但临床上相关的预后指标。迄今为止，微阵列分析已成功用于鉴定潜在的胶质瘤相关基因和分析某些生物网络。然而，从胶质瘤的基因芯片分析的证据表明，单个基因的研究提供了较差的临床结果的相关性。
　　 总的来说，未能凭经验开发有效的胶质瘤治疗方法，强调需要利用肿瘤样本的分子谱及其与临床参数的相关性来制定合理设计的治疗策略。在这项研究中，研究人员确定了三种差异表达的预后基因，这两种基因在两种胶质瘤表达谱中很常见。通过实时定量逆转录PCR（qPCR）验证基因表达。研究人员确定了PPIC，EMP3和CHI3L1在胶质瘤组织中上调。使用来自表达谱和TCGA数据集的已知存活数据验证DEPG的存活值。数据集的Kaplan-Meir分析显示这三个基因与生存相关，包括年级，年龄和治疗。总之，结果表明这些基因可能是用于高级别神经胶质瘤的诊断或治疗策略的合适生物标志物。
　　 为了研究三基因特征与年龄的关联，将患者分为50岁以下（年轻患者）和50岁以上（老年患者）年龄组的人群。年龄较小（50岁以下）的胶质瘤诊断是患者存活期较长的有力预测指标。如图5所示，它不能在GSE4412和TCGA中对老年患者进行显着分类。然而，在年轻患者组中，三基因特征显着地将患者分为高表达组和低表达组。与最近的报告一致，显示50岁以下的患者预后比50岁以上的患者更有利，研究人员的研究将50岁以下的大多数患者分类为低风险，50岁以上的患者为高风险。
　　 最近，基于微阵列的表达谱分析研究揭示了胶质瘤的分子事件，这可能具有预后价值。已经报道了基于基因表达数据集的研究根据已知的预后因素对患者进行分类。不幸的是，还没有报道预测胶质瘤的化疗反应。在本研究中，来自GSE4412和GSE7696数据集的微阵列数据用于鉴定长期和短期幸存者之间差异表达的预后基因。在交叉从上述两个数据集生成的DEPG之后，三个常见的DEPG（PPIC，EMP3和CHI3L1））被确定，表明这些基因可能是高级别胶质瘤患者预后的潜在预测因子。此外，研究人员的qPCR结果表明，PPIC，EMP3和CHI3L1的表达可以提供新的生物标志物，以帮助临床决策，关于针对个体患者的靶向治疗的新机会。
　　 其中，PPIC编码亲环蛋白C（Cyp-C），一种属于亲环蛋白家族的酶。从人肾cDNA文库中分离出人CyclophilinC。研究人员发现，亲环蛋白已经在多种细胞区室。亲环蛋白C相关蛋白（CyCAP）为77kDa的胞内蛋白，与被释放到细胞质和细胞膜。CyCAP的表达已经显示出通过伤口和缺血升高由于干扰素-γ（IFNγ）和肿瘤坏死因子-α（存在TNFα）。此外，删除CyCAP废除一个45kDa的纤连蛋白诱导的MMP-13的表达。然而，有关PPIC和胶质瘤的报道非常有限，胶质瘤的详细机制尚不清楚。
　　 EMP3是胶质瘤预后的另一个潜在预测因子。EMP3是外周髓鞘蛋白22-kDa（PMP22）基因家族（也称为TMP基因家族）的成员。的PMP22基因家族由五个成员，包括PMP22，EMP3，EMP2，和EMP1，和MP20。所述EMP3基因编码蛋白上皮细胞膜蛋白3（EMP3），含有四个跨膜结构域和在所述第一胞外环两个N-连接糖基化位点的163个氨基酸的蛋白。EMP3被认为参与细胞增殖和细胞-细胞相互作用。AlaminosM的一项研究表明，EMP3重新引入EMP3缺陷的癌细胞中抑制了异种移植物中的集落形成和肿瘤生长，表明EMP3基因的肿瘤抑制功能。EMP3也有报道显示频繁的启动子甲基化在高级别星形细胞瘤和神经母细胞瘤，两种肿瘤实体，在19q13.3显示频繁的等位基因缺失。
　　 此外，CHI3L1，也称为YKL-40，是一种分泌的40kDa糖蛋白，在几种人类癌症和其他以慢性炎症为特征的疾病中上调。的临床证据丰富显露的血清水平升高CHI3L1在GBM具有正癌症侵袭，抗辐射，复发相关，并减少患者存活时间。有迹象表明，建议数据CHI3L1表达可能是成胶质细胞瘤的预后因素。这与研究人员发现的相同。
　　 令人感兴趣的是，研究人员对具有TMZ信息的患者的单变量分析表明，三基因标记可以预测将从TMZ中受益的患者。基因标记在胶质瘤治疗管理中的应用仍需要在前瞻性TMZ临床试验中进一步评估。此外，三基因特征具有识别受益于放射疗法的患者的能力。因此，建立的基因标记可能有助于临床管理。
　　 合理使用微阵列数据集不仅可以更快，更简单地分析大量生物信息，而且有助于准确识别关键分子机制。在本研究中，研究人员提供了这些潜在标志物PPIC，EMP3和CHI3L1的表达。研究人员还鉴定并验证了新候选基因的预后价值。然而，它们在胶质瘤发展中的作用在很大程度上是未知的。因此，需要进一步研究以更精确地表征这些基因在胶质瘤进展中的功能意义，以及它们对胶质瘤预后的潜在应用。