从替莫唑胺治疗人脑胶质瘤的第一份治疗报告来看，甲基鸟嘌呤脱氧核糖核酸甲基转移酶已被证明是治疗耐药的重要机制。甲基转移酶表达很大程度上但不仅仅是，通过启动子甲基化控制。甲基转移酶甲基化的具体测量通常预测患有这些肿瘤的患者的反应和总体存活。一系列分子遗传技术可用于确定肿瘤中的甲基转移酶甲基化状态。但是，这些方法受专利保护，通常是昂贵的，并且对通常有限的组织具有破坏性。研究人员和其他人先前已经表明，甲基转移酶蛋白的免疫组织化学定位在检测核酶。一种抗甲基转移酶抗体开发，其免疫组织化学检测通过蛋白质印迹与脑肿瘤中的甲基转移酶蛋白检测相关。其他研究通过蛋白质印迹证实了甲基转移酶甲基化与蛋白质表达之间的相关性。甲基转移酶的免疫组化检测有许多报道的混杂因素，包括观察者间可靠性，复发与原发疾病之间的表达差异，浸润边缘与肿瘤中心之间的差异和检测方法之间的差异。毫不奇怪，文学有反对使用甲基转移酶免疫染色的作为临床生物标志物在脑肿瘤。许多论文表明，在肿瘤中发现的良性甲基转移酶表达细胞，如内皮细胞，淋巴细胞，小胶质细胞和巨噬细胞，可能在解释脑肿瘤的甲基转移酶免疫染色方面存在问题。渡边，中洲和索伦森使用连续切片免疫组织化学测量甲基转移酶，以使用各种标记物检测非肿瘤，炎性细胞标记物。以这种方式，他们鉴定了具有低非肿瘤细胞群的区域，其中计数肿瘤细胞中的甲基转移酶。他们发现，甲基转移酶在肿瘤细胞中的阳性率与胶质瘤患者的预后相关，支持这一发现。目前尚不清楚在脑肿瘤中浸润的炎性细胞是否是一种没有其自身混杂效应的生物现象。最近由提交的论文表明，具有致密浸润的阳性小胶质细胞的胶质母细胞瘤表现出延长的存活期，这一结果与相矛盾。
　　在一项初步研究中显示，通过对核甲基转移酶和非肿瘤细胞质和膜质元件进行双标记免疫组织化学检测胶质母细胞瘤中校正甲基转移酶状态的可行性。双标记免疫组织化学是一种已建立的技术，现在可在一些自动化免疫组织化学平台上获得。这种技术允许区分和同时测量肿瘤细胞和良性固有免疫和内皮细胞中的甲基转移酶。在过去的几年中，研究人员通过甲基转移酶甲基化和免疫组织化学两种方式测试了甲基转移酶状态。对于免疫组织化学方法，研究人员前瞻性地应用三重抗体，双标记方案来鉴定肿瘤细胞和炎症和内皮细胞中的甲基转移酶。细胞为了关注肿瘤细胞群，研究人员寻找具有最少细胞浸润的肿瘤区域。肿瘤甲基转移酶计入细胞细胞浸润最少的区域的非细胞质染色细胞，即“细胞冷点”。使用这种方法，研究人员测量了几个指标：未校正的甲基转移酶棕色核染色细胞除以面积中的总细胞数，细胞冷点百分比细胞;单鸡尾酒细胞质染色细胞数除以面积中的总细胞数和校正的甲基转移酶在未经染色的细胞中，具有甲基转移酶棕色阳性细胞核的细胞数除以未细胞的总数染色细胞。该技术允许校正细胞冷点中的细胞甲基转移酶正核。研究人员将这些发现与甲基转移酶甲基化状态进行了比较。研究人员对胶质母细胞瘤患者的分析表明，未校正的甲基转移酶评分和复杂的双染色技术得出校正的甲基转移酶％肿瘤核评分都与甲基转移酶甲基化状态和总体存活显着相关。研究人员的结果还表明，胶质母细胞瘤中发现的冷点细胞与总体存活有很强的正面影响。
　　 此外，生存数据可以与对甲基转移酶对存活效果的以往的研究进行比较是针对状态的幼稚肿瘤进行的。将当前研究与之前的研究进行比较可能不合适，因为事后看来，这些研究的缺点是状态是潜在的无法测量的混杂变量。这有助于进一步研究以充分了解的影响。本文描述的免疫组织化学方法未发现低级别星形细胞瘤的生存率，也未发现研究人员实验室先前在少突神经胶质瘤中的生存率。在回顾这些病例时，研究人员的结果证实了结果，即低级别神经胶质瘤具有更明显的浸润特征，其中良性神经胶质细胞并入肿瘤中。这些良性神经胶质元件未被抗体鉴定，因此包括在肿瘤细胞计数中。这些良性细胞是甲基转移酶的强表达者。由于甲基转移酶的甲基化与恶性基因型密切相关，因此建议在弥漫性胶质瘤中进行免疫组织化学检测的分子检测。